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小麦_膜片钳文献

发表于 2019-10-15
字数统计: 536 | 阅读时长 ≈ 2

搜索组合:“ wheat “patch clamp” ”

大概满意的:

https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-10933-5_35

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC159473/

http://www.plantphysiol.org/content/97/2/598.long?utm_source=TrendMD&utm_medium=cpc&utm_campaign=Plant_Physiol_TrendMD_0

耐盐和耐盐小麦品种根细胞质膜上阳离子通道的K + / Na +选择性不同

阳离子外向整流通道

研究小麦跟根细胞原生质体中阳离子外向通道的特性。
好像有细胞的膜片钳数据

通过综述找对应的文献

https://link.springer.com/article/10.1007/s00232-017-9969-7

https://link.springer.com/article/10.1134%2FS1990747817010068 考虑液泡

包括动作电位(AP)在内的电信号在植物适应不断变化的环境条件方面发挥着重要作用。需要进行AP生成机理的实验和理论研究,以了解环境因素与植物电活动之间的关系。在这项工作中,我们详细阐述了AP生成的数学模型,该模型考虑了液泡参与电响应的生成。该模型描述了质膜的转运蛋白(Ca 2 +,Cl –和K +通道,H +和Ca 2+ -ATPase,H + / K +反向转运蛋白和2H + / Cl–同向转运蛋白和液泡膜(Ca 2 +,Cl –和K +通道; H + -和Ca 2+ -ATPases; H + / K +,2H + / Cl –和3H + / Ca 2+反转运蛋白) ,并适当考虑第二信使(Ca 2+和IP3)的调节。还描述了质外性,细胞质和液泡缓冲液。模拟AP的特性与实验数据非常吻合。AP模型描述了液泡面积和体积增加时电信号的衰减。这种作用与钙的减少有关2+尖峰幅度。该电信号被弱由K个的影响+和Cl -中的液泡的内容。还显示,在模型的给定参数下,液泡IP 3依赖性Ca 2+通道对AP期间钙峰值产生的贡献微不足道。结果为液泡面积和体积在植物细胞兴奋性中的意义提供了理论证据。

关键词 “guard cells wheat channel

爬虫

效果:
1 搜索“***” 2 返回包含“&&&&&”关键词的页面

部署Myplant

发表于 2019-10-13
字数统计: 35 | 阅读时长 ≈ 1

– 安装hbase
– 安装mysql
– 安装vnc viewer
– 配置nginx

后台运行jar包

nohup java -jar demo-1.0.0-SNAPSHOT.jar > ./log1017.log 2>&1 &

保存图片画质

发表于 2019-10-11
字数统计: 33 | 阅读时长 ≈ 1

问题保存的图片不清晰,quality设置图片质量

plt.savefig(‘V=’+list(data.columns)[i]+’mV’, dpi=300,bbox_inches=’tight’, pad_inches=0.0,puality=95)

CAE

发表于 2019-10-10
字数统计: 30 | 阅读时长 ≈ 1

encoder_op.shape(?, 20),
decoder.shape:(10, 28, 28, 1),
y_pred.shape:(10, 28, 28, 1),
y_true.shape:(?, 28, 28, 1),
x_image.shape:(?, 28, 28, 1)

对电信号padding

训练记录

发表于 2019-10-09
字数统计: 62 | 阅读时长 ≈ 1

数据相似度比较高:
层次越小效果也好,loss值越低
序列的长度会影响预测的效果。

数据增强:
数据集添加噪声,
GAN ???

lstm编码器
BP编码器
卷积编码器
卷积lstm编码器

1…101112…25
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